現代アイヌのDNAはサンプル数が少なく決定的なものではないが、
岩宿時代に日琉共通祖先と分岐した非縄文系D1a2aのマーカが八割程度を占める。
アイヌ祖先は岩宿人・縄文人と共通する容貌や遺伝子を持っているものの、縄文時代開始以降に日琉共通祖先との交流は極めて少ない。
そうした拡散する岩宿人集団の一枝に、
カムチャツカに進出し、
オーストラロイドと古モンゴロイドに共通する特徴を持ったY-D1a2a集団がいた。
彼らは長期間孤立し、祖先的形質を長期に保持していた可能性が高い。
アイヌ祖先がオーストラロイド及び古モンゴロイドの祖先的形質を保持出来ていたのは、縄文時代が始まる前に、列島外の孤立した地域にいた可能性が高い。
